Hồ Sơ Tuyệt Mật mùa thứ tư tiếp tục xé toạc màng đêm của những bí ẩn và âm mưu với những lời tiên tri ma ám của thợ săn tiền thưởng ngoài hành tinh được đẩy mạnh đến mức đỉnh điểm. Tai họa kéo đến chẳng ngơi nghỉ khi mẹ của Mulder đứng trước cái chết cận kề và vụ sát hại bí ẩn của X, một ẩn số bí ẩn trong quá khứ đầy ám ảnh của nhân vật. Sự trở lại của Alex Krycek và dầu đen người ngoài hành tinh dường như bị lu mờ bởi sự thực đau lòng hơn – Scully bị chẩn đoán mắc bệnh ung thư. Sự tàn khốc của mùa này được nhân lên khi Max Fenig xuất hiện trở lại, với kết thúc bi thảm cho một đặc vụ FBI. Mặc dù loạt thảm họa này càng củng cố niềm tin của Mulder vào một âm mưu âm tối, ẩn chứa bóng tối, nhưng một sự thật kinh zatr biết đưa Scully đến bờ vực vực thẳm, gieo rắc vào Mulder một cuộc khủng hoảng niềm tin có thể biến thành sự thất bại cuối cùng.
Lòng đen nhất của chính phủ và những bí mật bềnh vực của những thực thể quyền lực ngày càng lộ diện. Mulder phải đối mặt với những nghi ngờ về chính mình, tin tưởng vào những lời cổ vũ của Samantha, trong khi Scully lâm vào trận chiến chống lại bệnh tật lẫn cuộc đấu tranh níu kéo hy vọng cho tương lai. Có thể mùa thứ tư là khúc dạo đầu của một tác phẩm bi kịch khổng lồ, đưa Mulder đến bờ vực tuyệt vọng, hoặc là một bước ngoặt ngoạn mục, dẫn anh đến sự triệt hạ những kẻ đứng sau màn đêm.
