Hồ Sơ Tuyệt Mật trở lại với phần 8 đầy những bí ẩn và hồi hộp. Sau khi Mulder biến mất bí ẩn, Đặc vụ Dana Scully quay trở lại trụ sở FBI với mảnh vỡ hy vọng. Cô muốn tìm kiếm Clues bất kỳ cho sự xuất hiện của đối tác cũ. Đặc vụ John Doggett, đang tiến hành cuộc truy tìm Mulder, bộc lộ lộ trình đầy hụt hẫng và vô vọng. Có thể nói rằng là một “nam-detective” bị đẩy vào môi trường X-Files đầy rẫy rắc rối. Scully và Skinner nhận ra rằng chiến lược truy tìm xưa không còn hữu hiệu, và họ tìm đến Lone Gunmen, đội quân siêu kỹ thuật viên chuyên nghiệp về cuộc điều tra những đề tài siêu nhiên lấp lánh ánh hào quang, để khám phá thông tin bí mật về hoạt động của các UFO trong thời gian Mulder mất tích. Nhìn sâu vào những manh mối đáng ngờ, họ đến với Gibson Praise, nhưng sự xuất hiện của một người đàn ông giả dạng Mulder trở thành bất ngờ kinh hoàng. Người đàn ông này không phải là Mulder mà là một thợ săn tiền thưởng người ngoài hành tinh, đến để cản trở cuộc hành trình tìm kiếm của Scully. Nhờ vào sự va chạm với kẻ địch khét tiếng, Scully nhận ra rằng việc tìm Mulder sẽ không giành được thành công dễ dàng như mong đợi. Đặc vụ Doggett chính thức nhận X-Files, bước vào hố sâu của điều tra bí mật. Scully trở thành người tin tưởng, người phải dìu dắt hiện tại của Doggett, một kẻ hoài nghi, để cùng nhau đi sâu vào mê cung bí ẩn của X-Files.
